Antes de la llegada de los españoles en 1510, había en esta región un poblado indígena llamado Darién, el mismo nombre del río que lo bordeaba. Su lengua era llamada Cueva y habitaban desde el río Chagres, en lo que hoy es Panamá, hasta el Golfo de Urabá. Era una región densamente poblada, según las fuentes documentales y el registro arqueológico. La organización social de esta población era jerárquica, en la forma de cacicazgo. Los pueblos no eran muy grandes y eran de forma dispersa, con varios grupos de casas con sus cultivos organizados alrededor de la casa de un principal y separados por vegetación. Se ubicaban cerca de las fuentes de agua, donde se practicaba la pesca con redes de algodón. También se cultivaba maíz, yuca y batatas. Las excavaciones realizadas en donde ahora está la Casa Patrimonial, revelaron datos sobre una fase más antigua del pueblo de Darién, alrededor del 1200 D.C. Era un poblado de grandes huertas con viviendas y un sistema de control de las aguas por canales de irrigación y drenaje.